婆罗洲、棉兰老岛、吕宋岛、也在这时候，出现此起彼伏的土著叛乱。甚至大明本土，也出现新移民武装叛乱的情况。
整个大明，也第一次，遭受炮火的洗礼。
正是如此危险的时刻，大明高层，也出现了异样。本来一直潜伏在穿越者体内的x元素，突然变得非常活跃。那些返老还童的现代人，也出现快速衰老的情形。
大明的行政层，一下子陷入停摆。
包括总统杨崇在内，都无法幸免。
而最早带他们穿越过来的高铁，也突然运转了起来。不少陷入衰老的现代人，也在南峰的指挥下，被一个个送进了高铁。
这样过了三天，高铁的车轮，猛然动了。
明京市，也在这一天，电闪雷鸣、大雨倾盆。迎着风雨，高铁缓缓消失在夜色中。
这一神迹，被众多大明人认为，是仙人乘坐神龙，前往了仙界。
于是还留在大明的一部分穿越者，立即行动起来。以第一时间，组织起临时政府，进行总统选举。同时命在大清征战的明军，积极改编大清俘虏。
在进行一定的军事训练后，就将他们投入到南洋平叛。
日本的武士，也被大明扩招了十万人。他们和清军俘虏一样，被投入了南洋战场。并且他们的任务，还是将所有叛乱之地，都清剿得不留活口。一场针对南洋土著的大屠杀，也正式展开。
从叛乱开始的1799年开始，到南洋禁令结束的1809年。婆罗洲、棉兰老岛、吕宋岛、马来半岛，人口都十不存一。就是有侥幸存活的，也被逼进了原始丛林，过着原始人一样的生活。
大明本土的叛乱，则被驻守在本土的夏州军团，以最快的速度剿灭。